CEFAS26-11 Rammeavtale for Next Generation Sequencing Services

Cefas søker å etablere en rammeavtale for levering av Next-Generation Sequencing (NGS) tjenester, for en rekke NGS-analyseteknikker, for å støtte leveringen av tallrike og varierte forskningsprogrammer som benytter genomikk. Rammeavtalen er delt inn i 4 Lots, og Leverandører kan by på et hvilket som helst antall Lots. Cefas har til hensikt å tildele opptil 5 kontrakter for hver Lot, basert på at Leverandørene oppfyller de nødvendige tekniske og prisvurderingskriteriene. Cefas vil deretter hente fra rammeavtalen for individuelle prosjektkrav, som angitt i det fullstendige kravspesifikasjonsdokumentet i Bidder Pack. Hvis en Leverandør tildeles flere Lots, vil én kontrakt bli tildelt for å dekke de relevante Lots. Kontraktsimplementeringen forventes å starte i august 2026 for en periode på 3 år, med mulighet for forlengelse i 2 ytterligere perioder på 12 måneder hver. Prisene vil være faste for den innledende 3-årsperioden av kontrakten. Prisene kan deretter økes årlig hvis kontrakten forlenges, i samsvar med KPI. Fullstendige detaljer om anbudet og rammeavtaleprosessene er angitt i Bidder Pack-dokumentene. MERK: Alle Leverandører som byr på et hvilket som helst antall Lots må fylle ut Procurement Specific Questionnaire Envelope. Lot 1 - Målrettet Sekvensering Leverandører vil levere målrettede sekvenseringsanalyser, som: • Amplikonsekvensering og metabarkoding, primært ved bruk av 16S, 18S, COI og ITS markører, men også andre tilpassede primere kan være nødvendige ad hoc. • Bibliotekberikelse, som bait capture/hybrid probe capture teknikker. Lot 2 - Hele Genomet Leverandører vil levere sekvensering av hele genomet, metagenomisk og transkriptomisk, i applikasjoner som: • Sekvensering av hele genomet/metagenomisk for mikrobiell diversitet, mikrobiomanalyse, artsidentifikasjon, patogendeteksjon, genom-assembly, AMR-screening, populasjonsgenetikk. • Transkriptomisk/enkeltcelle/romlig transkriptomisk sekvensering for vert-patogen-interaksjoner, funksjonell annotering/klassifisering, metabolske veier, genuttrykk. Lot 3 - Lang-lese Sekvensering Leverandører vil levere lang-lese sekvenseringsanalyse, ved bruk av enten PacBio eller Oxford Nanopore Technologies. Dette kan være for flere forskjellige applikasjoner, primært studier av: • Mikrobiell diversitet, mikrobiomanalyse, artsidentifikasjon, patogendeteksjon • Hele genom-assembly, AMR-screening, populasjonsgenetikk • Nanopore-spesifikk - Metyleringssekvensering, epigenetikk Lot 4 - Ad Hoc Krav Leverandører vil håndtere ad hoc-forespørsler, dvs. de som ikke passer inn i de foregående lot-kategoriene. Dette vil mest sannsynlig bli brukt når en unik/proprietær teknologi eller analyse er nødvendig, som RAD-Seq, som Cefas ikke kan utføre internt. Spesifikasjoner vil bli detaljert i den individuelle prosjektforespørselen via call-off-prosessen, som vil være en mini-konkurranseprosess som angitt i Vedlegg 4.