Original udbudsbeskrivelse
Cefas søger at etablere en rammeaftale for levering af Next-Generation Sequencing (NGS) services, for en række forskellige NGS-analyseteknikker, til at understøtte leveringen af talrige og varierede forskningsprogrammer, der anvender genomik.
Rammeaftalen er opdelt i 4 Lots, og leverandører kan byde på et hvilket som helst antal Lots. Cefas har til hensigt at tildele op til 5 kontrakter for hver Lot, baseret på leverandørernes opfyldelse af de krævede tekniske og prisvurderingskriterier. Cefas vil derefter foretage call-off fra rammeaftalen for individuelle projektkrav, som angivet i det fulde kravspecifikationsdokument i Bidder Pack. Hvis en leverandør tildeles flere Lots, vil én kontrakt blive tildelt for at dække de relevante Lots.
Kontraktens implementering forventes at starte i august 2026 for en periode på 3 år med mulighed for at forlænge i yderligere 2 perioder af 12 måneder hver.
Priserne vil være faste for den indledende 3-årige periode af kontrakten. Priserne kan derefter stige årligt, hvis kontrakten forlænges, i overensstemmelse med CPI.
Fuldstændige detaljer om udbuddet og rammeaftaleprocesserne er angivet i Bidder Pack-dokumenterne.
BEMÆRK: Alle leverandører, der byder på et hvilket som helst antal Lots, skal udfylde Procurement Specific Questionnaire Envelope.
Lot 1 - Målrettet sekventering
Leverandører vil levere målrettede sekvenzingsanalyser, såsom:
• Amplikonsekventering og metabarcoding, primært ved brug af 16S, 18S, COI og ITS markører, men også andre brugerdefinerede primere kan være nødvendige ad hoc.
• Biblioteksberigelse, såsom bait capture/hybrid probe capture teknikker.
Lot 2 - Hele Genomet
Leverandører vil levere sekventering af hele genomet, metagenomisk og transkriptomisk, i applikationer som:
• Sekventering af hele genomet/metagenomisk for mikrobiel diversitet, mikrobiomanalyse, artsidentifikation, patogendetektion, genom-assembly, AMR-screening, populationsgenetik.
• Transkriptomisk/enkeltcelle/spatial transkriptomisk sekventering for vært-patogen-interaktioner, funktionel annotering/klassificering, metaboliske veje, genekspression.
Lot 3 - Lang-læse Sekventering
Leverandører vil levere lang-læse sekvenzingsanalyse, ved brug af enten PacBio eller Oxford Nanopore Technologies. Dette kan være til flere forskellige applikationer, primært studier af:
• Mikrobiel diversitet, mikrobiomanalyse, artsidentifikation, patogendetektion
• Hele genom-assembly, AMR-screening, populationsgenetik
• Nanopore-specifik - Methyleringssekventering, epigenetik
Lot 4 - Ad hoc Krav
Leverandører vil håndtere ad hoc-anmodninger, dvs. dem, der ikke passer ind i de foregående lot-kategorier. Dette vil mest sandsynligt blive anvendt, når en unik/proprietær teknologi eller analyse er påkrævet, såsom RAD-Seq, som Cefas ikke kan udføre internt.
Specifikationer vil blive detaljeret i den individuelle projektanmodning via call-off-processen, som vil være en mini-konkurrenceproces som angivet i Bilag 4.