Analyse d'images fixes du récif de Pobie Bank 0923S

Objectifs du projet Le JNCC souhaite passer un contrat pour l'analyse d'images fixes du fond marin collectées lors de la campagne 0923S à l'aide d'une caméra largable. Les images du fond marin seront analysées à l'aide du logiciel d'annotation d'images BIIGLE. Au cours de la campagne 0923S, des données d'imagerie ont été collectées à la fois pour la surveillance des AMP et à des fins de vérification au sol. Le nombre total de stations de surveillance par caméra largable échantillonnées était de 97 et le nombre total d'images après filtrage pour garantir 40 images de bonne qualité par station est de 3 880. L'analyse de 10 stations de vérification au sol avec 383 images doit être incluse uniquement en tant que supplément payant, cependant le coût total, y compris les suppléments payants, ne doit pas dépasser la valeur stipulée du contrat. Des métadonnées plus détaillées seront fournies, y compris des informations provenant des journaux et du rapport de campagne. Des images représentatives de chaque station de la campagne 0923S sont présentées à l'Annexe C, et l'entrepreneur retenu aura accès au projet BIIGLE de 2023, aux images vidéo PBR annotées de 2023 et aux images du fond marin PBR de 2020 pour aider à l'identification. 3. Contexte du projet Le JNCC et la Direction de la mer (MD) ont mené une campagne à bord du MRV Scotia (0923S) en 2023 pour recueillir des preuves afin de surveiller le récif de Pobie Bank SAC (PBR) (Figure 1) et d'informer l'évaluation de l'étendue et de l'état des caractéristiques désignées du site. Il s'agit de la deuxième campagne de surveillance dans une série temporelle répétée à PBR, trois ans après la première campagne en 2020, et vise à générer des résultats comparables pour tirer des conclusions à long terme sur l'état du site. PBR est situé en mer du Nord, à environ 20 km à l'est des îles Shetland. Le site a une superficie de 966 km2 et une profondeur variant de 70 m à 100 m. Les caractéristiques désignées de PBR sont énumérées dans le Tableau 1. Plus d'informations sur PBR peuvent être trouvées dans le JNCC SIC https://jncc.gov.uk/our-work/pobie-bank-reef-mpa/. Tableau 1 : Caractéristiques désignées du récif de Pobie Bank SAC. Caractéristique Type de caractéristique 1170 Récifs Habitat de l'Annexe I • Produire un rapport d'analyse final comprenant, au minimum, des sections détaillant la méthodologie, les résultats et les détails de tout le travail d'assurance qualité effectué avec toute action corrective jugée nécessaire. Le rapport ne doit pas dépasser 15 000 mots, y compris tous les tableaux et annexes, et doit être fourni électroniquement par e-mail sous forme de document Microsoft Word et PDF. • Fournir des collections de référence d'images de substrat et taxonomiques pour chaque type de substrat et taxon identifié à partir des images. • (Supplément payant) Entreprendre l'analyse telle que définie pour les stations de surveillance pour 383 images fixes supplémentaires provenant des 10 stations de vérification au sol. • (Supplément payant) Créer un sous-ensemble de 100 images fixes annotées d'une manière appropriée pour servir de données d'entraînement pour la formation de modèles d'intelligence artificielle, comme décrit ci-dessous. Certaines informations, lorsqu'elles sont spécifiées, peuvent être enregistrées directement dans les formulaires fournis. La majorité sera d'abord enregistrée dans BIIGLE, puis utilisée pour remplir le formulaire. Aucune analyse supplémentaire à celle décrite dans ce document n'est requise. Tout écart par rapport à cette méthodologie doit être approuvé par écrit par le responsable du projet. 4.1 Traitement des images fixes Les images fixes doivent être analysées dans BIIGLE en utilisant les arbres d'étiquettes présentés dans le Tableau 2. Les annotations doivent être ajoutées aux images fixes en tant qu'étiquettes de niveau 1 ou 2, en fonction de l'arbre d'étiquettes utilisé. Facultativement, les étiquettes de niveau 1 peuvent être ajoutées directement dans le formulaire au lieu d'être appliquées aux images fixes, auquel cas cela doit être cohérent (c'est-à-dire qu'il ne doit pas y avoir de mélange d'annotations BIIGLE et d'entrées de formulaire pour la qualité d'image JNCC). Plus de détails sur les types d'annotation d'images et leur application sont fournis dans l'Annexe A. Les images fixes seront analysées pour extraire les informations suivantes : 1. Chaque image fixe se verra attribuer une qualité d'image à l'aide d'étiquettes provenant de deux arbres d'étiquettes. Si une image fixe reçoit une note de zéro (équivalent NMBAQC), aucune analyse supplémentaire ne doit être effectuée pour cette image et l'entrepreneur doit alerter le JNCC pour remplacer l'image par une image de qualité appropriée : a. Qualité d'image JNCC, un résumé de ces étiquettes est présenté dans le Tableau 3. b. Qualité d'image NMBAQC, un résumé de ces scores est décrit plus en détail dans la section 3.1 de Turner et al (2016). 2. Annoter chaque image fixe à l'aide de l'arbre d'étiquettes Biota. Cet arbre est pré-rempli avec une liste de taxons identifiés en 2020 et de nouvelles espèces doivent être ajoutées. Pour chaque image fixe, les taxons doivent être identifiés et quantifiés à l'aide de l'approche standardisée détaillée dans l'Annexe B. Lorsqu'un taxon non identifié précédemment est observé, les approches suivantes doivent être utilisées : a. Espèces épifaunales solitaires et/ou dressées présentes (jusqu'au niveau taxonomique le plus bas pour lequel l'identification est garantie) en utilisant des comptages (obtenus à l'aide de l'outil d'annotation de points dans BIIGLE). b. Espèces épifaunales coloniales et/ou encroûtantes présentes dans la mesure du possible (jusqu'au niveau taxonomique le plus bas pour lequel l'identification est garantie) en utilisant la couverture en pourcentage (obtenue à l'aide des outils de polygone, baguette magique, magic SAM ou pinceau dans BIIGLE). c. Cas spéciaux, tels que lorsqu'un taxon est présent en haute densité (c'est-à-dire Ophiothrix fragilis, Caryophyllia smithii, tapis faunistique), peuvent être enregistrés directement dans la feuille de calcul de niveau 1 comme une estimation du nombre, ou une estimation de la couverture en pourcentage à 0,5 % près. Ces cas sont identifiés dans l'Annexe B. 3. Utiliser l'arbre d'étiquettes de points laser pour annoter les lasers et calculer la surface de l'image dans BIIGLE. Les analystes ne doivent pas utiliser l'outil de détection automatique de lasers dans BIIGLE. 4. Identifier les preuves d'impacts anthropiques sur le fond marin : a. Utiliser l'arbre d'étiquettes de déchets pour enregistrer la présence de déchets en utilisant les catégories énumérées à l'Annexe 5.1 du Guide du Centre Commun de Recherche sur la Surveillance des Déchets Marins dans les Mers Européennes (Joint Research Centres Guidance on Monitoring of Marine Litter in European Seas). b. Utiliser l'arbre d'étiquettes anthropiques pour annoter les marques de chalutage ou les impacts anthropiques autres que les déchets. Il ne s'agira pas d'un arbre d'étiquettes complet et de nouvelles étiquettes pourraient devoir être ajoutées. 5. Utiliser l'arbre d'étiquettes de substrat pour enregistrer les types de substrat présents à 0,5 % près directement dans le formulaire. a. Des grilles superposées 10 x 10 doivent être utilisées pour aider à estimer le pourcentage de couverture. 6. Tous les commentaires de l'analyste jugés importants peuvent être enregistrés dans la feuille de calcul. Une collection de référence d'images représentatives doit être fournie pour chaque étiquette Biota et chaque substrat identifié. Tableau 3. Catégories de qualité d'image JNCC • Niveau de qualité de l'image • Description • Faune • La plupart des faunes peuvent être identifiées (par exemple, y compris les taxons plus petits tels que les ophiures, etc.) • Faune visible • La faune grande et visible peut être identifiée (par exemple, éponges, coraux mous, etc.) • Substrat • Le type de substrat peut être identifié, mais la faune ne le peut pas (par exemple, la colonne d'eau est obstruée / la caméra est trop haute par rapport au fond marin) • Zéro • Aucune visibilité du fond marin, le substrat ne peut pas être identifié de manière fiable. 4.2 Assurance qualité Après l'attribution du contrat, et en fonction des scores d'évaluation qu'ils obtiennent, les soumissionnaires non retenus peuvent être invités à entreprendre les aspects d'assurance qualité externe indépendante de ce projet. Veuillez indiquer dans votre offre si vous ne souhaitez pas être pris en considération pour ce travail. Note : l'analyse d'assurance qualité externe peut être effectuée en même temps que l'analyse primaire si le contractant retenu le préfère et si un processus approprié est convenu avec le JNCC lors de la réunion de démarrage. 4.2.1 Processus d'assurance qualité interne pour l'analyse d'images Un minimum de 10 % des images fixes analysées doivent faire l'objet d'un processus d'assurance qualité interne. 4.2.2 Processus d'assurance qualité externe pour l'analyse d'images Un contrat distinct sera géré par le JNCC pour le processus d'assurance qualité externe. Il sera mené comme décrit dans cette section. 10 % des images fixes analysées doivent faire l'objet d'un processus d'assurance qualité externe indépendant. Les étapes suivantes seront respectées : • Les images fixes à contrôler seront sélectionnées par le JNCC ; • Les analystes auditeurs reçoivent les données d'imagerie du JNCC ; • Les analystes auditeurs effectuent l'analyse des images fixes pour les images sélectionnées, comme décrit dans la section 4.1, et remplissent la section de l'analyste auditeur du formulaire de comparaison ; • Le formulaire de comparaison est envoyé au JNCC et aux analystes d'origine ; • Les analystes d'origine remplissent entièrement le formulaire de comparaison d'analyse d'images JNCC partiellement rempli ; • Le JNCC, les analystes d'origine et les analystes auditeurs se réunissent pour résoudre tout écart dans l'identification et la quantification des taxons à la satisfaction de toutes les parties. Toute action corrective requise suite au processus d'assurance qualité doit être complétée par les analystes d'origine dans un délai convenu, sans frais supplémentaires pour le projet. Il est de la responsabilité de l'entrepreneur retenu de s'assurer que ce processus est terminé avant la livraison finale de l'ensemble de données. Toutes les actions correctives entreprises et leur justification associée doivent être approuvées par le JNCC avant d'être mises en œuvre, enregistrées et fournies comme résultats de ce contrat. Toutes les actions correctives entreprises et leur justification associée doivent être enregistrées et fournies comme résultats de ce contrat. Le contrat ne sera pas considéré comme complet tant que cette étape d'assurance qualité externe n'aura pas été menée à bien.