Original udbudsbeskrivelse
Projektets mål
JNCC ønsker at bestille en kontrakt til analyse af bundbilleder indsamlet på 0923S-undersøgelsen fra et drop-kamera. Bundbilleder vil blive analyseret ved hjælp af billedannoteringssoftwaren BIIGLE. Under 0923S blev billeddata indsamlet til både MPA-overvågning og til jordafprøvningsformål.
Det samlede antal prøvede drop-kamera overvågningsstationer var 97, og det samlede antal billeder efter filtrering for at sikre 40 billeder af god kvalitet pr. station er 3.880. Analyse af 10 jordafprøvningsstationer med 383 billeder skal kun inkluderes som en betalt ekstra, men den samlede pris inklusive betalte ekstra må ikke overstige den angivne kontraktværdi.
Mere detaljerede metadata vil blive leveret, herunder oplysninger fra logfiler og undersøgelsesrapporten. Repræsentative billeder fra hver station fra 0923S-undersøgelsen vises i bilag C, og den succesfulde entreprenør vil få adgang til BIIGLE-projektet fra 2023, de annoterede PBR-videooptagelser fra 2023 og PBR-bundbillederne fra 2020 for at hjælpe med identifikation.
3. Projektbaggrund
JNCC og Marine Directorate (MD) udførte en undersøgelse ombord på MRV Scotia (0923S) i 2023 for at indsamle beviser til overvågning af Pobie Bank Reef SAC (PBR) (Figur 1) og informere vurderingen af omfanget og tilstanden af de udpegede træk ved stedet. Dette er den anden overvågningsundersøgelse i en gentaget tidsserie ved PBR, tre år efter den første undersøgelse i 2020, og sigter mod at generere sammenlignelige resultater for at drage langsigtede konklusioner om stedets tilstand.
PBR ligger i Nordsøen ca. 20 km øst for Shetland. Stedet har et areal på 966 km2 og en dybde på 70 m til 100 m. De udpegede træk ved PBR er angivet i Tabel 1. Mere information om PBR kan findes i JNCC SIC https://jncc.gov.uk/our-work/pobie-bank-reef-mpa/.
Tabel 1: Udpegede træk ved Pobie Bank Reef SAC.
Træk Træktype
1170 Rev
Habitat i bilag I
• Udarbejd en endelig analyse rapport, der som minimum indeholder sektioner, der beskriver metodologien, resultater og detaljer om alt udført QA-arbejde med eventuelle nødvendige afhjælpende foranstaltninger. Rapporten bør ikke være længere end 15.000 ord, inklusive alle tabeller og bilag, og skal leveres elektronisk via e-mail som et Microsoft Word-dokument og PDF.
• Levere referencemateriale af substrat- og taksonomiske billeder for hver substrat type og taxon identificeret fra billeder.
• (Betalt ekstra) Udfør analysen som angivet for overvågningsstationerne for yderligere 383 billeder fra de 10 jordafprøvningsstationer.
• (Betalt ekstra) Opret en undergruppe af 100 billeder annoteret på en måde, der er egnet til at fungere som træningsdata for kunstig intelligens modeltræning som beskrevet nedenfor.
Nogle oplysninger, hvor specificeret, kan registreres direkte i de leverede formularer. Størstedelen vil blive registreret først i BIIGLE og derefter brugt til at udfylde formularen. Ingen yderligere analyse ud over det, der er beskrevet i dette dokument, er påkrævet. Enhver afvigelse fra denne metodologi skal godkendes skriftligt af projektlederen.
4.1 Billedbehandling
Billeder skal analyseres i BIIGLE ved hjælp af mærketræerne vist i Tabel 2. Annotationer skal tilføjes til billeder som enten niveau 1 eller niveau 2 mærker afhængigt af det anvendte mærketræ. Valgfrit kan niveau 1 mærker tilføjes direkte i formularen i stedet for at blive anvendt på billeder, hvor dette gøres, skal det være konsekvent (dvs. der bør ikke være en blanding af BIIGLE-annotationer og formularposter for JNCC-billedkvalitet). Mere detaljerede oplysninger om billedannoteringstyper og hvordan de skal anvendes, findes i bilag A.
Billeder vil blive analyseret for at udtrække følgende oplysninger:
1. Hvert billede vil blive tildelt en billedkvalitet ved hjælp af mærker fra to mærketræer. Hvis et billede får en score på nul (NMBAQC-ækvivalent), må der ikke udføres yderligere analyse for det billede, og entreprenøren skal underrette JNCC om at erstatte billedet med et af passende kvalitet:
a. JNCC billedkvalitet, en oversigt over disse mærker er vist i Tabel 3.
b. NMBAQC billedkvalitet, en oversigt over disse scorer er beskrevet mere detaljeret i afsnit 3.1 af Turner et al (2016).
2. Annoter hvert billede ved hjælp af Biota mærketræet. Dette træ er forudfyldt med en liste over taxoner identificeret i 2020, og nye arter skal tilføjes. For hvert billede skal taxoner identificeres og kvantificeres ved hjælp af den standardiserede tilgang beskrevet i bilag B. Hvor et tidligere uidentificeret taxon observeres, skal følgende tilgange anvendes:
a. Enkelte og/eller oprette epifauna arter til stede (til det laveste taksonomiske niveau, hvor identifikation er garanteret) ved hjælp af tællinger (opnået ved hjælp af punkt-annoteringsværktøjet i BIIGLE).
b. Koloniale og/eller dækkende epifauna arter til stede så vidt muligt (til det laveste taksonomiske niveau, hvor identifikation er garanteret) ved hjælp af procentvis dækning (opnået ved hjælp af polygon-, tryllestavs-, magic SAM- eller penselværktøjerne i BIIGLE).
c. Særlige tilfælde, såsom hvor et taxon er til stede i høje tætheder (dvs. Ophiothrix fragilis, Caryophyllia smithii, fauna græs), kan registreres direkte i niveau 1 regnearket som et estimat af antal, eller et estimat af procentvis dækning til nærmeste 0,5%. Disse tilfælde er identificeret i bilag B.
3. Brug laserpunkternes mærketræ til at annotere lasere og beregne billedareal i BIIGLE. Analytikere må ikke bruge det automatiske laserdetektionsværktøj i BIIGLE.
4. Identificer beviser for antropogene påvirkninger på havbunden:
a. Brug affalds-mærketræet til at registrere tilstedeværelsen af affald ved hjælp af kategorierne anført i bilag 5.1 i Joint Research Centres Guidance on Monitoring of Marine Litter in European Seas.
b. Brug det antropogene mærketræ til at annotere trawl-mærker eller antropogene påvirkninger ud over affald. Dette vil ikke være et komplet mærketræ, og nye mærker kan være nødvendige.
5. Brug substrat-mærketræet til at registrere de tilstedeværende substrattyper til nærmeste 0,5 procent direkte i formularen.
a. 10 x 10 overlappende gitre bør bruges til at hjælpe med estimater af procentvis dækning.
6. Eventuelle kommentarer fra analytikeren, der anses for vigtige, kan registreres i regnearket.
En reference samling af repræsentative billeder skal leveres for hver Biota mærke og Substrat identificeret.
Tabel 3. JNCC billedkvalitet kategorier
• Billedkvalitetsniveau • Beskrivelse
• Fauna • De fleste fauna kan identificeres (f.eks. inklusive mindre taxoner som piskestjerner osv.)
• Iøjnefaldende fauna • Stor og iøjnefaldende fauna kan identificeres (f.eks. svampe, bløde koraller osv.)
• Substrat • Substrattypen kan identificeres, men faunaen kan ikke (f.eks. vandsøjlen er sløret / kameraet er for højt over havbunden)
• Nul • Ingen synlighed af havbunden, substrat kan ikke pålideligt identificeres.
4.2 Kvalitetssikring
Efter tildeling af kontrakten, og afhængigt af de opnåede evalueringsscorer, kan ikke-vindende budgivere blive inviteret til at udføre de uafhængige eksterne QA-aspekter af dette projekt. Angiv venligst i dit tilbud, hvis du ikke ønsker at blive taget i betragtning til dette arbejde.
Bemærk: ekstern QA-analyse kan udføres samtidigt med primær analyse, hvis det foretrækkes af den succesfulde entreprenør, og en passende proces er aftalt med JNCC på opstartsmødet.
4.2.1 Intern kvalitetssikringsproces for billedanalyse
Mindst 10% af de analyserede billeder skal gennemgå en intern kvalitetssikringsproces.
4.2.2 Ekstern kvalitetssikringsproces for billedanalyse
En separat kontrakt vil blive udført af JNCC for den eksterne QA-proces. Den vil blive udført som beskrevet i dette afsnit.
10% af de analyserede billeder skal gennemgå en uafhængig ekstern QA-proces.
Følgende trin vil blive overholdt:
• Billeder, der skal kvalitetssikres, vil blive udvalgt af JNCC;
• Auditerende analytikere modtager billeddata fra JNCC;
• Auditerende analytikere udfører billedanalysen for udvalgte billeder som beskrevet i afsnit 4.1 og udfylder den auditerende analytikers del af sammenligningsformularen;
• Sammenligningsformularen sendes til JNCC og de oprindelige analytikere;
• De oprindelige analytikere udfylder fuldt ud den delvist udfyldte JNCC-billedanalysesammenligningsformular;
• JNCC, de oprindelige og de auditerende analytikere mødes for at løse eventuelle uoverensstemmelser i taksonidentifikation og optælling til alles tilfredshed.
Eventuelle afhjælpende foranstaltninger, der kræves efter QA-processen, skal udføres af de oprindelige analytikere inden for en aftalt tidsramme uden ekstra omkostninger for projektet. Det er den succesfulde entreprenørs ansvar at sikre, at denne proces er afsluttet, før datasættet leveres endeligt. Alle afhjælpende foranstaltninger og tilhørende begrundelser skal aftales med JNCC, før de implementeres, registreres og leveres som resultater af denne kontrakt. Alle afhjælpende foranstaltninger og tilhørende begrundelser skal registreres og leveres som resultater af denne kontrakt. Kontrakten anses ikke for at være fuldført, før dette eksterne kvalitetssikringstrin er gennemført med succes.