Originele aanbestedingsbeschrijving
Cefas streeft ernaar een raamovereenkomst op te zetten voor de levering van Next-Generation Sequencing (NGS) services, voor een verscheidenheid aan NGS-analysemethoden, ter ondersteuning van de levering van talrijke en gevarieerde onderzoeksprogramma's die gebruik maken van genomica.
De raamovereenkomst is opgesplitst in 4 Lots en Leveranciers kunnen op elk aantal Lots inschrijven. Cefas is van plan om maximaal 5 Contracten per Lot toe te kennen, gebaseerd op de naleving door de Leveranciers van de vereiste technische en prijsbeoordelingscriteria. Cefas zal vervolgens uit de raamovereenkomst putten voor individuele projectvereisten, zoals uiteengezet in het volledige Specificatie van Vereisten document in het Bidder Pack. Indien een Leverancier meerdere Lots wordt toegekend, wordt één Contract toegekend om de betreffende Lots te dekken.
De implementatie van het Contract zal naar verwachting beginnen in augustus 2026 voor een periode van 3 jaar, met de optie om te verlengen voor 2 verdere perioden van elk 12 maanden.
Prijzen zullen vast zijn voor de initiële 3-jarige periode van het Contract. Prijzen kunnen vervolgens jaarlijks worden verhoogd indien het Contract wordt verlengd, in lijn met de CPI.
Volledige details van de aanbesteding en de raamovereenkomstprocessen zijn uiteengezet in de Bidder Pack-documenten.
LET OP: Alle Leveranciers die inschrijven op een willekeurig aantal Lots moeten de Procurement Specific Questionnaire Envelope invullen.
Lot 1 - Gerichte Sequencing
Leveranciers zullen gerichte sequencinganalyses leveren, zoals:
• Amplicon sequencing en metabarcoding, voornamelijk gebruikmakend van 16S, 18S, COI en ITS markers, maar ook andere aangepaste primers kunnen ad hoc nodig zijn.
• Bibliotheekverrijking, zoals bait capture/hybrid probe capture technieken.
Lot 2 - Gehele Genoom
Leveranciers zullen sequencing van het gehele genoom, metagenomische en transcriptomische sequencing leveren, in toepassingen zoals:
• Gehele genoom/metagenomische sequencing voor microbiële diversiteit, microbiome analyse, soortidentificatie, pathogeen detectie, genoom assemblage, AMR screening, populatiegenetica.
• Transcriptomische/single-cell/spatiële transcriptomische sequencing voor gastheer-pathogeen interacties, functionele annotatie/classificatie, metabole paden, genexpressie.
Lot 3 - Long-Read Sequencing
Leveranciers zullen long-read sequencing analyse leveren, met behulp van PacBio of Oxford Nanopore Technologies. Dit kan voor verschillende toepassingen zijn, voornamelijk studies van:
• Microbiële diversiteit, microbiome analyse, soortidentificatie, pathogeen detectie
• Gehele genoom assemblage, AMR screening, populatiegenetica
• Nanopore-specifiek - Methylatie sequencing, epigenetica
Lot 4 - Ad hoc Vereisten
Leveranciers zullen ad hoc-verzoeken uitvoeren, d.w.z. die welke niet in de voorgaande lot-categorieën passen. Dit zou hoogstwaarschijnlijk worden gebruikt wanneer een unieke/propriëtaire technologie of analyse vereist is, zoals RAD-Seq, die Cefas niet intern kan uitvoeren.
Specificaties zullen worden uiteengezet in het individuele projectverzoek via het call-off proces, dat een mini-competitieproces zal zijn zoals uiteengezet in Bijlage 4.