Oriģinālais iepirkuma apraksts
Cefas vēlas izveidot pamatlīgumu, lai nodrošinātu nākamās paaudzes sekvenēšanas (NGS) pakalpojumus, izmantojot dažādas NGS analīzes metodes, lai atbalstītu daudzu un dažādu genomspektīvu pētniecības programmu īstenošanu.
Pamatlīgums ir sadalīts 4 daļās, un piegādātāji var piedalīties jebkurā daļu skaitā. Cefas plāno piešķirt līdz 5 līgumiem katrai daļai, pamatojoties uz piegādātāju atbilstību prasībām attiecībā uz tehnisko un cenu novērtējumu. Pēc tam Cefas izmantos pamatlīgumu individuālu projektu prasību izpildei, kā noteikts pilnā prasību specifikācijā piegādātāju dokumentu paketē. Ja piegādātājam tiek piešķirtas vairākas daļas, tiks piešķirts viens līgums, kas aptver attiecīgās daļas.
Paredzams, ka līguma īstenošana sāksies 2026. gada augustā uz 3 gadiem ar iespēju pagarināt to vēl par 2 periodiem pa 12 mēnešiem katrs.
Cenas būs fiksētas līguma sākotnējā 3 gadu periodā. Cenas var tikt palielinātas ik gadu, ja līgums tiek pagarināts, saskaņā ar CPI.
Pilna informācija par iepirkumu un pamatlīguma procesiem ir sniegta piegādātāju dokumentu paketē.
LŪDZAM ŅEMT VĒRĀ: Visi piegādātāji, kas piedalās jebkurā daļu skaitā, ir jāaizpilda Iepirkuma specifiskā anketas aploksne.
1. daļa - Mērķtiecīga sekvenēšana
Piegādātāji nodrošinās mērķtiecīgas sekvenēšanas analīzes, piemēram:
• Amplikonu sekvenēšana un metabarkodēšana, galvenokārt izmantojot 16S, 18S, COI un ITS marķierus, bet pēc vajadzības arī citus pielāgotus primerus.
• Bibliotēkas bagātināšana, piemēram, ēsmas uztveršanas/hibrīdu zondes uztveršanas tehnikas.
2. daļa - Kopsavilkums
Piegādātāji nodrošinās kopsavilkuma, metagenomu un transkriptomu sekvenēšanu lietojumprogrammās, piemēram:
• Kopsavilkuma/metagenomu sekvenēšana mikrobu daudzveidībai, mikrobioma analīzei, sugu identifikācijai, patogēnu noteikšanai, genoma salikšanai, AMR skrīningam, populācijas ģenētikai.
• Transkriptomu/vienas šūnas/telpiskās transkriptomu sekvenēšana saimnieka-patogēna mijiedarbībai, funkcionālai anotācijai/klasifikācijai, metaboliskajiem ceļiem, gēnu ekspresijai.
3. daļa - Ilgtermiņa sekvenēšana
Piegādātāji nodrošinās ilgtermiņa sekvenēšanas analīzi, izmantojot PacBio vai Oxford Nanopore Technologies. Tas var būt dažādiem lietojumiem, galvenokārt pētījumiem par:
• Mikrobu daudzveidībai, mikrobioma analīzei, sugu identifikācijai, patogēnu noteikšanai
• Kopsavilkuma genoma salikšanai, AMR skrīningam, populācijas ģenētikai
• Nanopore-specifiskai - metilēšanas sekvenēšanai, epigenētikai
4. daļa - Neparedzētas prasības
Piegādātāji apmierinās neparedzētas prasības, t.i., tās, kas neatbilst iepriekšējo daļu kategorijām. Tas visbiežāk tiktu izmantots, ja nepieciešama unikāla/patentēta tehnoloģija vai analīze, piemēram, RAD-Seq, ko Cefas nevar veikt iekšēji.
Specifiskā informācija tiks detalizēti aprakstīta individuālā projekta pieprasījumā, izmantojot pasūtījumu procesu, kas būs mini-konkursa process, kā noteikts 4. pielikumā.